Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms