Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930550L24RikQ99PA7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms