Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms