Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Nkd1Q99MH6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms