Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms