Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms