Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RtcbQ99LF4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms