Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1aQ99L02 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms