Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PpifQ99KR7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PpifQ99KR7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PpifQ99KR7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PpifQ99KR7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpifQ99KR7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms