Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emc3Q99KI3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms