Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LsrQ99KG5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LsrQ99KG5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms