Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp11Q99K46 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp11Q99K46 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms