Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms