Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec3Q99J72 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms