Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ophn1Q99J31 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ophn1Q99J31 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms