Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn16Q925N4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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