Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PdgfdQ925I7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PdgfdQ925I7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PdgfdQ925I7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PdgfdQ925I7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PdgfdQ925I7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PdgfdQ925I7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PdgfdQ925I7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfdQ925I7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfdQ925I7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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