Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rnf144aQ925F3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rnf144aQ925F3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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