Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg1Q925E1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms