Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripply3Q924S9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms