Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrif1Q923B3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms