Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms