Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms