Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms