Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx18Q91ZR2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms