Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atpaf2Q91YY4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms