Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms