Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc49Q91YK0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc49Q91YK0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc49Q91YK0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc49Q91YK0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc49Q91YK0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc49Q91YK0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms