Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Setd3Q91WC0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms