Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms