Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cox4i2Q91W29 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms