Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms