Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn8Q91VA3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn8Q91VA3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms