Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mark1Q8VHJ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mark1Q8VHJ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms