Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30aQ8VEK0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem30aQ8VEK0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms