Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Smg8Q8VE18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Smg8Q8VE18 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Smg8Q8VE18 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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