Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TgdsQ8VDR7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TgdsQ8VDR7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms