Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgtbQ8VD33 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms