Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg2Q8VCK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms