Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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