Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh10Q8VCH7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms