Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms