Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg10Q8R1P4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms