Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms