Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z9

Pom121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, mousemouse

Predictions only

Length 1,200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121Q8K3Z9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pom121Q8K3Z9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pom121Q8K3Z9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms