Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptnQ8K3K8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms