Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk5rap2Q8K389 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms