Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms