Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms