Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms